Het UMCG verleent zorg op grond van de Zorgverzekeringswet. De verplichte toelating in het kader van de Wet toetreding zorgaanbieders (Wtza) is geregistreerd onder instellingsnummer 1435.

Het UMCG is ingericht als een matrixorganisatie met clusters van afdelingen en diverse dwarsverbanden. In de clusters zijn afdelingen en comprehensive centra opgenomen. Daarnaast beschikt het UMCG over ondersteunende onderdelen die verantwoordelijk zijn voor alle ondersteunende taken (zie organogram). De benoeming en het ontslag van de leiding van deze onderdelen worden verzorgd door de raad van bestuur.

Voor integrale sturing op de kerntaken is het Integraal Besturingsteam (IBT) ingericht. Het IBT bestaat uit: 

• de raad van bestuur;
• de leiding van clusters en dwarsverbanden;
• afdelingshoofden;
• voorzitters van comprehensive centra;
• directeuren van ondersteunende onderdelen;
• portefeuillehouders uit de clusters.

De raad van bestuur kan, onder voorwaarden, bevoegdheden delegeren aan het IBT.

Binnen de clusters vormen de afdelingen de basis voor patiëntenzorg, onderzoek, opleidingen en onderwijs. Clusters zijn integraal verantwoordelijk voor de resultaten op de kerntaken.

Voor drie beleidsmatige speerpunten kent het UMCG comprehensive centra: 

• Oncologiecentrum;
• Transplantatiecentrum;
• Centrum Acute Zorg.

Een comprehensive center is, met een cluster als basis, een organisatiemodel voor een meer integrale en multidisciplinaire werkwijze, georganiseerd rondom de patiënt en afdelings- en clusteroverstijgend ingericht. 

De (financiële) besturingsfilosofie is gebaseerd op decentrale resultaatverantwoordelijkheid en integraal besturen. De raad van bestuur maakt jaarlijks afspraken met clusters en dwarsverbanden over doelstellingen en middelen.